轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析）圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中，都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細(xì)胞系中，通過(guò)敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達(dá)差異的microRNA,說(shuō)明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步通過(guò)MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當(dāng)一部分的microRNA具有m6A修飾。通過(guò)motif分析，他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復(fù)雜性上增加了一個(gè)新的層次。圖FTO敲除對(duì)甲基化的miRNAs的穩(wěn)定狀態(tài)的影響。參考文獻(xiàn)Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。腫瘤細(xì)胞侵襲能力檢測(cè)在學(xué)（遷移、侵襲）和免疫學(xué)（遷移、趨化）中是常規(guī)實(shí)驗(yàn)。貴州實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選（細(xì)胞水平的結(jié)合和阻斷）、CAR分子的殺傷活性評(píng)價(jià)。材料與儀器（以慢pMSCV載體為例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細(xì)胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物，分別在引物兩端加入酶切位點(diǎn)EcoRI和BglII。2)從細(xì)胞中提取目的基因mRNA，然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA，然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴(kuò)增出來(lái)。PCR擴(kuò)增出帶有酶切位點(diǎn)的目的基因編碼區(qū)序列，連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α，分別進(jìn)行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列，電泳割膠回收純化，連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α，菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后，送至公司測(cè)序、鑒定。4)鑒定成功后，將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中，并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中，并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。云南組織科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室隨著科技的不斷進(jìn)步，科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型，更好地為人類健康保駕護(hù)航。

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過(guò)度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長(zhǎng)。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR，作者確定了SOCS2（細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子）作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之，METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過(guò)m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此，作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過(guò)程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。

實(shí)驗(yàn)樣本分類實(shí)驗(yàn)一般采取樣本有：血液樣本、樣本和細(xì)胞樣本。通常，樣本采集后，應(yīng)立即用等滲溶液（PBS或生理鹽水）盡量把血液漂洗干凈（除非血液也是分析對(duì)象），用濾紙或紗布吸干，把樣本分切成幾分，每份的體積約2個(gè)黃豆大小，每份用一個(gè)管子裝。血液樣本的采集應(yīng)根據(jù)不同實(shí)驗(yàn)的要求，將會(huì)采取不同策略。血清樣本：全血中不加抗凝劑，血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黃色透明液體。（全血標(biāo)本室溫放置2小時(shí)3000rpm/min離心15min）血漿樣本：全血中加抗凝劑，血液凝固后取出的含凝血因子的淡黃色透明液體。（可用EDTA或肝素作為抗凝劑，標(biāo)本采集后30分鐘內(nèi)于2-8℃，3000rpm/min離心15min）如果是做生化\ELISA等檢測(cè)可以考慮血漿和血清，根據(jù)獲得的樣本量可考慮分裝成100-500μl/管，可避免反復(fù)凍融造成的檢測(cè)誤差。生化：建議優(yōu)先選擇血清，其次選擇肝素抗凝血漿；ELISA：建議優(yōu)先選擇血清，其次選擇肝素或EDTA抗凝血漿；凝血實(shí)驗(yàn)：只能選擇枸櫞酸鈉抗凝血漿；血常規(guī)：只能選擇EDTA抗凝全血；如果要收集其中的白細(xì)胞、血小板等建議用抗凝全血。如果要做流式建議用專門的流式用血液收集管，防止表面抗原的丟失，或者盡快安排就近檢測(cè)。樣本處理取樣完后。動(dòng)物疾病模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。

膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素：有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài)；伴發(fā)多個(gè)功能障礙；有較高的自然死亡率，根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸，要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%～70%；膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過(guò)度造成的自身?yè)p傷，不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷，故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6～12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠，因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克，且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大，而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型？盲腸結(jié)扎穿孔模型（CLP）模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型，被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段：盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng)，其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎，進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。動(dòng)物疾病模型：為人類健康保駕護(hù)航。貴州乳鼠科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買

維持細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境的穩(wěn)定。細(xì)胞質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)的液體，其中包含了各種細(xì)胞器和細(xì)胞骨架等結(jié)構(gòu)。貴州實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

METTL3能夠促進(jìn)肺腺細(xì)胞的生長(zhǎng)、生存和侵襲，但還不清楚它是否作為m6A調(diào)節(jié)器或效應(yīng)器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細(xì)胞白血病（AML）患者中，m(6)A調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53突變存在密切聯(lián)系，且m(6)A調(diào)控基因的改變與AML不良預(yù)相關(guān)[26]。此外，F(xiàn)TO在AML中高表達(dá)，它通過(guò)降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平，調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點(diǎn)的表達(dá)，增強(qiáng)了白血病基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病形成，并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)的AML細(xì)胞分化[27]。在脂肪形成過(guò)程中，F(xiàn)TO表達(dá)與m6A水平成負(fù)相關(guān)，促進(jìn)脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細(xì)胞瘤樣細(xì)胞中，ALKBH5通過(guò)lncRNAFOXM1介導(dǎo)FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細(xì)胞的成瘤性[28]。此外，甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除，能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達(dá)，極大地促進(jìn)了膠質(zhì)瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)、自我更新和形成[29]。圖2m6ARNA修飾和介導(dǎo)的功能[30]m6A的研究方向主要是通過(guò)研究m6A修飾相關(guān)的甲基化、去甲基化酶和識(shí)別蛋白的功能，進(jìn)而研究m6A修飾的生物學(xué)功能和作用機(jī)制：一般通過(guò)敲除m6A酶分子，研究下游功能基因分子的表達(dá)和m6A甲基化情況，通過(guò)介導(dǎo)相關(guān)基因異常（可變剪切、穩(wěn)定性、翻譯、miRNA調(diào)控）影響細(xì)胞表型和功能特征。貴州實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)