外泌體的功能外泌體可能作為細胞之間物質和信號通訊的途徑,不同的細胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現細胞間通訊,這些外泌體被受體細胞吸收,通過物質交換或釋放內含物實現物質和信號的交流。外泌體與受體細胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現:外泌體表面膜蛋白質被目的細胞表面的受體識別,從而靶細胞;外泌體在蛋白酶作用下產生的表面膜蛋白質碎片可作為目的細胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細胞膜融合,將蛋白質和RNA等內容物釋放進去,此類膜融合可能改變靶細胞的一些膜特性,例如脂質和膜蛋白質的密度及種類;目的細胞通過胞吞的形式攝入外泌體經由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運輸到周邊靶細胞或經血液等體液運輸而被遠處組織細胞攝取,進而影響目的細胞的基本功能和基因表達。幾乎所有的細胞都可以在自發或在一定刺激條件下產生外泌體,不同的細胞產生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發生與發展、抗原呈遞、免疫調節、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現以及心血管健康中發揮作用??蒲屑夹g服務的價值在于將科研成果轉化為實際應用,推動社會進步與發展。寧夏哪里有科研技術服務培養
RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調控mRNA穩定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發現了METTL3(甲基轉移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統,內源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內生長。通過轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2??傊?,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發現了在肝發生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。山西大鼠科研技術服務技術將Transwell小室放入配套培養板中,形成由細胞可穿透性膜分隔開的兩室系統,將高營養液與低營養液分隔開。
m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。
3)基因/蛋白質表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中,保持核酸和蛋白質的完整性至關重要,因此在取樣過程中,應盡量避免核酸及蛋白質的降解。如不注意采樣過程,將會導致樣本中的核酸及蛋白質的無差別降解,嚴重影響后續分子檢測結果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應立刻裝入凍存管內,并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分,也是發表至關重要的分子檢測數據。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉錄層面的變化進行定性或定量檢測,而WB則主要用來對某一蛋白質的表達進行定量檢測。(4)轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關產業的不斷發展,各類組學檢測的價格降低,實驗設計中也常常運用組學檢測來提升實驗設計的檔次。在我們進行轉錄組學及蛋白質組學的檢測過程中,同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質的片段完整性。免疫沉淀技術是一種研究蛋白質間交互作用的生物技術。
采用opti-MEM和Lipo3000分別轉染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質粒及對照載體,每皿加入脂質體-質粒轉染混懸液按購買脂質體相關說明書操作定量。繼續培養24h。2)24小時后,將培養基更換為新鮮的DMEM完全培養基,放進細胞培養箱繼續培養48~72h。3)48~72h后收集上層培養液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉染1)轉染前1天將細胞接種6孔培養板,時細胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養基。2)冰浴融化后加入相應體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續培養3)4h后補充1mL培養基,14h后換液(24h內換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監測效率,出現較多熒光時將等量的轉染細胞和未轉染細胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時,降低Puromycin濃度培養。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養,以得到滿意的穩定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株:a.正常細胞株;b.空載載體的細胞株。飼養動物及干預 動物購買后需要將時間節點提前規劃好。動物科研技術服務實驗
EdU細胞增殖檢測是一種新型的細胞增殖檢測方法。寧夏哪里有科研技術服務培養
是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發現的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結合能力,進而調控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發現FTO調節異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關,揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調節功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發現具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現出精子發生異常,這可能是精子發生相關基因表達改變的結果[7]。m6AmRNA修飾執行其功能主要通過兩個途徑:精細調控甲基化轉錄本的結構,以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結合蛋白識別,誘發續反應。目前一類含有YTH功能結構域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。寧夏哪里有科研技術服務培養